中国从封建时代初期开始，宫廷就有医疗机构。秦汉时有御医令，隋唐时改为宋代御医局，晋代改称御医院，任命点为长官，明清时有。

清泰医院在礼部的领导下，是“主管医疗事务，并领导其提供医疗服务”的独立机构。

除了人员的选拔，还要经过礼部。平时清泰医院独立开展行政业务。有一个首席，称为法院大使，和两个副主任，称为左和右法院法官。有10-15个医生，10-30个官员，20-40个医生，20-30个擅长食物的医生，20-30个不擅长药物的医生。

这个编制在清代虽然有增有减，但总体制度保持不变。宫廷大使是五级官员，御医被授予七级官员，允许使用六条品冠腰带。

清泰医院原址位于故宫东墙(东华门以北)，民国初年迁至地安门外东大街以北。

清初，太极医院分为大房脉、小房脉、伤寒、妇科、溃烂、针灸、眼科、口腔科、骨科、预防接种等11个科室。后来痘痘科并入小方静脉，疮科并入牙科。

乾隆年间，太医院管9科。清中叶后，伤寒材、妇科并入大方脉，疮疡科改为外科，废除针灸正骨。所以光绪《会典》记载太极医院有五个科室：大房脉、小房脉、外科、眼科、口腔科。

太医院从医院到医土都要根据自己的行业和水平“到内廷”(到内宫服务)，轮流值班。职责分为内在价值和外在价值。内值在各宫外室值班，又称宫值；外值在东药房值班，又称六值。

所有被皇宫召到内廷(内廷)的医官，都要由内廷药局的太监带领。他们在为皇帝疾病的诊治开出药方后，必须与御药局的太监一起将药物组合，共同将药方盖章，才有这份报告中药方所列药物的药性和治疗方案。

医官和太监在月日(日期)签上自己的名字，然后呈给皇帝宣读。打完这个(报告)后，这个章会登记在册，太监为了考得好，会去取。

御药熬制时，御医院的医官和御药房的太监一起监制，两药合为一服。煎好后，分别倒入两个杯中，其中一杯先由主治医官品尝，再由朝廷判官、太监依次品尝，再将另一杯呈送皇帝取用。

如果不按原处方和不守纪律的药味、药量配制药物，或者处方有误，就会被视为“不敬”。

清泰医院的神医除了直接任命的，还有很多是各地推荐的。

他们既有深厚的中医理论和丰富的临床经验，又有良好的文学修养。在辨证论治方面，他们在方药上有条不紊，用药安全，尤其是对慢性病理。地方官没有真才实学，不敢向皇帝推荐。

此外，宫廷医药之丰富、之精良，非百姓所能及。因此，泰医院的医疗成就和医疗水平可以说代表了当时全国的最高医疗水平。

为了培养宫廷医务人员和中医人才，清代太极医院还设有医学教育讲堂