柠檬果实贮藏期间的真菌性病害主要有：黑腐病、酸腐病、茎腐病、蓝绿霉病、炭疽病；生理性疾病主要有：干疤、水肿。

蒂腐病：可分为褐蒂腐病和黑蒂腐病，症状相似，但褐蒂腐病与健康组织无明显界限，后期有发酵气味。黑蒂腐斑与健康组织界限明显，后期有臭味。病原体从花梗侵入果实组织。刚开始病变是水涝，后来病变继续扩大，逐渐变成褐色或黑色。腐烂通过果实中心的速度比沿着果皮的速度快。在多雨潮湿的产区或年份尤为严重。

黑腐病：初期症状是果实的花梗变黑，病菌沿果实中柱向下发展。菌丝所到之处，变黑腐烂。在果实生长发育过程中，黑腐病菌大多存在于果实的花梗中，直到花梗组织被破坏后才能侵入柠檬组织内部。任何削弱果实的条件，如不适宜的环境、晚收或长期储存，都会增加果实对黑腐病的敏感性。

青霉菌：指青霉菌和青霉菌引起的两种贮藏性疾病。发病过程和症状相似。初期，果皮表面变软，出现水渍状斑点。随着病斑的扩大，白色菌丝生长，迅速变成蓝色或绿色的霉菌层。从发病到整个果实腐烂只需要1-2周。病原体通过接触或气流传播。从伤口和裂缝侵入，所以最根本的预防措施是减少机械损伤。在世界上所有商业化的柑橘产区，蓝霉病和绿霉病是最常见的采后腐烂原因。

酸腐病：初期症状为微凸涝渍浅黄色至黄色斑点，细菌主要生长在果实内部。在后期，水果的所有内部组织都分解成酸水状的粘性物质。24-29时，从感染到全果腐烂只需5天，相邻的果实也会受到感染，病菌会从伤口侵入。

(5)炭疽病：发病始于蒂部，初期外部症状为灰色至褐色斑点，随后斑点迅速扩大，有时扩展至整个果实。在潮湿的条件下，表面出现粉红色的孢子，然后孢子群由褐色变为黑色，直到后期，细菌才侵入果肉深层。主要侵染橘子，柠檬果实偶有发生，在潮湿地区和年份严重。病原菌生长在果园的枯枝或弱枝上，并从那里向果实扩散，通过破损的果皮或枯果蒂进入果实。

上述疾病的防治方法：除采后处理外，可采用药物进行防治。该方法如下：

(1)噻菌灵(泰克，TBZ)和苯菌灵(苯菌灵):是最有效的采后杀菌剂，可有效防治茎腐病和青霉菌、绿霉菌，对炭疽病有一定作用，但对酸腐病和黑腐病作用不明显。这两种杀菌剂微溶于水，常用作蜡水混合溶液或水悬液。处理时，必须不断摇动悬浮液，以确保药液的均匀性。噻菌灵的浓度为1？000mg/L、600mg/L，果实采收后浸泡3-5分钟。

(2)邻苯基苯酚钠(SOPP):可防治茎腐病、青霉病、绿霉病，对酸腐病也有一定作用，尤其对橙子效果更好。pH值为11.5-12.0的2%邻苯酚钠溶液药效最高，所以常用的配方是：2%邻苯酚钠0.2%NaOH 1%六胺，或1%邻苯酚钠蜡溶液均可。

(3)仲丁胺：可防治青霉病和绿霉病，对茎腐病作用低，对酸腐病和炭疽病无效。仲丁胺是一种沸点为63的液体。可作为仓库熏蒸剂(25-200mg/L，V/V，42h)，也可制成1%-2%的水溶液浸泡水果。

(4)联苯：可防治茎腐病、青霉病、绿霉病，但对酸腐病无效。它是一种蒸汽杀菌剂。常用的方法是：将渗透性包装纸按照2.35 g: 1张(27.9cm43.2cm)的比例浸渍联苯，制成联苯包装纸。联苯

褐斑(干疤):多发生在贮藏中后期。初期症状为浅棕色不规则斑，随后颜色变深，病灶扩大，低温下发展为以椎弓根为中心的不规则环状病灶。病变处的油细胞破裂。凹陷干燥萎缩，位置仅限于外果皮。大多数人认为这是一种低温失调的生理疾病(BrooksMccolloch1936李沛文，1977)。在低温低湿条件下贮藏，病害尤为严重。在储藏中，通过适当的措施，如晚收获、高湿度、低O2和高CO2以避免低温储藏，可以控制和减少褐斑病的发病率。

水肿：初期果皮变淡，部分果皮出现不规则半透明的水渍状斑点，有煤油味。重病后全果半透明渍水，柔软易剥，酒味浓。如果继续存放，会被其他致病菌感染而腐烂。大量实验表明，过低的储存温度和不良的通风会导致CO2的过量积累，从而引发水肿病。只要两种因素中的任何一种存在一定时间，就会发生水肿性疾病，当两种因素同时存在时，就会发生得更早、更严重。因此，柠檬果实水肿病的防治应注意防止贮藏温度过低或波动过大，同时加强管理，注意通风。