有很多种真菌可以感染杏树。尽管一些病害的病原已经鉴定和分离，侵染循环和适宜条件也已明确，如褐腐病、霉斑穿孔病、褐斑穿孔病、杏黑星病、腐烂病、杏疖病、冠腐病、白羽病、环腐病等，但要成功防治仍有许多问题有待进一步研究。

1.杏流胶病。杏流胶病最初被认为是南半球的一种疾病，后来在美国、意大利、瑞士、法国、前苏联和匈牙利也发现了这种疾病。据报道，轮枝菌属、轮枝菌属、大丽轮枝菌属和真棉轮枝菌属都是致病的。葡萄球壳藻胶引起的日本杏流胶。甲基硫菌灵能有效抑制菌丝生长、孢子萌发和症状发展。在促进病斑间组织再生，保证树势的同时，843康复剂(腐植酸加其他化学物质)在防治流胶病方面效果突出。此外，细菌也会引起流胶病。在国外强调伤口要涂杀菌保护剂，用苯并咪唑类药物控制。

但也有人指出，不能只把上胶归结为微生物感染，因为在没有细菌感染的情况下，也会形成少量的胶。认为核果类果树的牙龈出血是一种生理性疾病，是外界因素诱导合成大量乙烯，刺激产生过量的细胞壁多糖，导致牙龈出血。对杏树、酸樱桃、李子和桃树施用高浓度的乙烯利通常会导致大量流胶。筛选合适的乙烯合成抑制剂(如AVG、三氯苯酚和苯甲酸钠)来减少核果类果树的流胶是有希望的。

2.杏的果点。杏果斑病在中国、印度等许多国家都有发生。引起甘肃杏果实斑点病的病原有3种，分别是嗜果Clasterosporiumcarpophilum、链格孢属(Alternariatenuis)和野油菜黄单胞菌属(Xanthomonascampestrispv.pruni)。这些病原体也会导致叶片穿孔。其中分布最广、危害最大的是嗜果伞，主要以菌丝体在树上和地面上越冬，翌年以孢子从叶片的气孔和果实的皮孔侵入。抗病性研究表明，叶肉海绵的气孔大小、气孔密度、叶面积和细胞密度与抗病性呈正相关。此外，许多学者开展了抗病品种的筛选研究，获得了一些免疫和高抗品种。

3.杏子衰退。该病与疫霉菌的危害有关。疫霉和丁香疫霉都能引起根腐病、干腐病和干溃疡，导致生长衰弱甚至死亡。此外，丛枝菌根菌和疫霉菌的结合也导致杏的衰退。LimT。m研究了用磷酸控制由疫霉引起的颈腐病和干腐病。在澳大利亚维多利亚州，20年生杏树干在接种前注射8-10g/株的磷酸，可防止病害形成12个月。如果接种后注射，磷酸可以延缓病变的发展，使其干燥恢复。

4.树叶烧焦。该病于1978年在奥地利首次发现，1985年、1986年和1987年流行。病原鉴定为(芹菜素)，开叶期后喷施地噻农、多菌灵、代森锰锌3-5次效果较好。用十二烷基胍和二噻农对红叶矮缩病引起的叶片烧伤进行喷施，可有效降低短枝和长枝上的受害叶片比例。

5.杏锈病。SimeoneA。m研究了杏品种的抗病性。参试的95个品种对锈病和刺孢霉素非常敏感，其中52个品种感病严重，7个品种感病程度较低。对杏的抗性研究表明，斯塔克、早、橙、切斯特和科凡具有高度抗性或免疫。塔库尔夫。指出二噻农对控制翻白草花蕾膨大和花瓣脱落是有效的。

6.杏树枯死、花腐、斑驳落叶等真菌性病害。据介绍，黄萎病(Vinturiaalbo-atrum)主要分布在澳洲，花轮、大理的黄萎病(V.danliat)主要分布在美国和法国。用毒性最大的胞孢菌素(CytosporacinctaSacc)属的菌丝或分生孢子悬液接种，可使杏的顶梢死亡。整个欧洲，除了干热的地中海岩石，都受到这种疾病的危害，很难治愈，只能预防。据报道，Cytospora、AleksanderChernyz等品种是枝枯病的主要病原。香蕉孢子叶枯病一年四季均可发生，木质部是全年的敏感部位，而韧皮部和形成层仅在7月以后发生并形成杏树的死枝。杏枝枯病的生物防治试验表明，利用荧光假单胞菌、木霉、梭孢霉和壳孢霉的分离物可以在栽培过程和枝上控制病原菌。

莫尼列菌属、果锈菌属和M.laxa在加利福尼亚引起花腐和果腐。通过研究发现，所有菌株均对Benoit敏感，而不同地区的果实分枝杆菌对Benoit的敏感性不同。所选用的有效药剂为0.05%的苄达唑、0.1%的福达唑(有效成分为苄达唑)或0.06%的甲基硫菌灵。喷施期为芽膨大期、绿蕾期、白蕾期、40%-50%花期、80%-100%花期。如果感染不严重，可以在白蕾期和40%-50%开花期处理。分别对抗病品种的筛选进行了研究。

据报道，链格孢霉(Fr。)链格孢属的Keissl、A.tenuisNees和A.tenuissima(Fries)Wiltshir均引起链格孢，但危害不严重。仅1981年在罗马尼亚发生一次，可危害杏、李、樱桃、核桃的叶和茎，也可危害成熟果实。