玉米秸秆还田可以增加土壤有机质含量，改善土壤理化性质和团粒结构，已成为当今各地增产稳产的一项非常重要的措施。但如果配套技术不到位，就会导致苗黄、苗弱、病情加重、缺苗、断垄等一些不良现象。

玉米秸秆还田后，秸秆中的养分不能被作物直接吸收利用，而必须被微生物分解。适合土壤微生物活动的碳氮比为251至301，而玉米秸秆的碳氮比为801至1001。如果土壤中氮不足，微生物和小麦会争夺氮，小麦就会因缺氮而变黄变弱。因此，在秸秆还田的小麦基肥中应添加氮肥。在小麦正常施肥的基础上，可添加5~7.5公斤尿素，以满足小麦和微生物对养分的需求，加速秸秆的分解腐烂。

防治病虫害玉米秸秆往往含有大量病菌和虫卵，在直接粉碎的过程中无法杀死，还田后残留在土壤中。农田病虫害尤其是地下害虫有逐年增加的趋势，危及小麦的正常生长。小麦播种期应做好种子化学处理和麦田病虫害综合防治，做到“防重于治”。最好买包衣种子或者用化学药剂拌种。先混农药，堆闷后再混杀菌剂，晾干后可以播种。混有杀菌剂的种子不宜久放。在地下害虫严重的地区，还应采用化学土壤处理。

防止玉米秸秆因缺苗、断垄而大量还田，使土壤变得疏松、空隙增大，水分流失更快。种子难以与土壤紧密接触，影响种子的萌发和出苗。田间出苗往往不规律，容易出现缺苗断垄现象。一是在提高秸秆还田质量的前提下，坚持秸秆还田必须深耕，旋耕麦田必须镇压。二是小麦应在秸秆还田后播种，播种量在正常基础上适当增加0.5 ~ 2公斤。播种时应随播随压，使种子与土壤紧密接触，保证基本苗充足。第三，要把土壤的水分还田，“晚播不如脚底播”，这样才能种出足够的土壤水分，保证一次播完所有的苗。播种后土壤水分不足时，也可及时浇水。及时查苗补苗。冬季浇水要早，水量要小，让土壤下沉。浇水后也要及时耕锄，打破板结。