大豆需要更多的氮、磷、钾，尤其是大豆富含蛋白质，需要更多的氮。由于大豆根瘤菌能固定空气中的氮，大豆中氮肥的施用往往被忽视。事实上，根瘤菌固定的氮只能满足大豆对氮需求的1/3 ~ 1/4。因此，要种好大豆，60% ~ 70%的氮营养必须从土壤中施用。但大豆不适合施基肥。基肥施用过量后，会严重影响出苗和生根，种肥也会对大豆的胚根和下胚轴造成严重伤害，甚至导致部分种子不能发芽。因此，大豆追肥尤为重要。根据大豆生长发育规律，大豆追肥主要把握三个阶段，一是苗期，二是开花结荚期，三是灌浆期。

大豆出苗后，一般黄豆芽展开一片复叶时，每亩可施尿素3 ~ 5公斤追肥。绿色食品大豆不追化肥，追有机肥，每亩施500斤优质农肥。如果幼苗健壮，没有肥料，苗期可以不施或少施氮肥，避免植株白长。

开花结荚期是需肥的关键期，也是大豆生长发育最旺盛的时期。大豆开花前5 ~ 7天或初花期施用适量氮肥，可促进碳水化合物和蛋白质的形成，减少花荚脱落，促进早熟，增加产量，效果明显。结果表明，这一时期的产量比不施氮肥的普通亩增产10%以上。一般每公顷追施硝酸铵200 ~ 250公斤或尿素130 ~ 160公斤，结合中耕和土壤栽培。

大豆进入结荚鼓粒期，根系活力下降，根瘤菌固氮能力逐渐下降，吸肥能力减弱。在鼓粒期，大豆吸收的氮和磷分别占整个生育期的60%和65%。因此，应采用根外追肥即叶面喷施来提高大豆成熟度，增加百粒重，改善大豆品质。在籽粒灌浆期和结荚末期追施氮肥，既能满足大豆籽粒灌浆的需要，又不会使植株长势旺盛，因而能大幅度提高籽粒产量。