1. 不同的概念。大家应该都很熟悉社会保障，它包含五种保险，也就是我们常说的“五险”。我们现在每个月都缴纳社保，当我们看到社保从工资中扣除时，对于工资不高的年轻人来说，他们的工资会更少。新型农村合作医疗的作用相当于社会保障中的医疗保险，是农民看病的保障。

2. 付款时间和费用不同。大家都知道社保是每月交的，而且是公司帮忙交的，在我们家的社保中，公司是员工出的很大一部分。但新型农村合作医疗制度有所不同。每年由农民支付一次，费用由农民自己支付。费用方面，新农村一体化一年220元，和社保不同，是按个人工资支付的。

3.不同的报销率。上述人士还表示，新型农村合作医疗是农民看病的保障，对职工来说，社会保障也是他们看病的保障。虽然两者都是医疗保险，但两者之间的报销比例也不同。社会保障的报销比例比新型农村合作医疗高5个点左右，所以对于这一点，我们还是要知道，在使用社会保障或者新型农村合作医疗的时候，要核对报销比例。

4. 不同的支付群体。想要交新农合，第一选择就是你必须要有农村户口，否则就交不了，但是社保不一样，没有那么多要求，只要你在城市参加工作，那么公司就可以帮你交社保，即使户口是农村也是一样的。因此，许多农民在农村缴纳新型农村合作医疗，在城市缴纳社会保险。但在报销方面，你只能选择一种。

5、不同的保险年限。社会保险每月支付一次，从下一个月起不能报销医疗费用。参加15年的保险后，你可以在退休后每月领取养老金。一般来说，男性保满25年，女性保满20年，退休后仍然可以享受医疗报销待遇。新型农村合作医疗实行一年一次。只要是农村户口，社保和新型农村合作医疗都可以同时购买。但是，两者是冲突的，不能报销两次。