弧菌会攻击鱼、虾等水生动物，造成弧菌病，经济损失严重。弧菌广泛分布于海洋和河口环境，属于弧菌科，目前由147个种和4个亚种组成。今天给大家分享一篇利用gyrB和pyrH基因分离弧菌的文章。引用的信息如下：

分子鉴定

16SrRNA基因已被广泛用作鉴定物种的分子标记。但是，弧菌的16SrRNA很难区分近缘种。此外，16SrRNA基因的种内(98.8%100%)和种间(97.6%99.9%)序列的相似性，以及大量的重叠，导致几乎没有区分能力。

持家基因

例如，gyrB和pyrH基因通常用于聚合酶链式反应(PCR)和多位点序列分析(MLSA)以确定弧菌的物种多样性。由于两个基因的种内和种间距离略有重叠，gyrB和pyrH基因比16SrRNA基因具有更高的区分能力。

样本分离

从马来西亚半岛的四个石斑鱼养殖场分离到弧菌。从4个养殖场的77份样品(64%)中成功分离出147株弧菌，其中北方24株(16%)，东部30株(21%)，中部66株(45%)，南方27株(18%)。其中62株来自脾脏(42%)，45株来自肾脏(31%)，40株来自肝脏(27%)。

gyrB和pyrH序列的系统发育分析

gyrB序列分析显示，131个菌株(89%)可分为6种弧菌。共鉴定出63株(43%)为哈氏弧菌，53株(36%)为溶藻弧菌，8株(5%)为副溶血弧菌，3株(2%)为塔弧菌，1株(1%)为创伤弧菌。此外，使用该基因不能区分哈氏弧菌和轮虫弧菌。

通过分析pyrH序列，所有147个菌株(100%)可以被识别，然后分成11个弧菌菌株。其中，三种弧菌在马来西亚养殖场中占优势，如创伤弧菌、哈氏弧菌和副溶血弧菌。创伤弧菌有49株(33%)。

总结

与gyrB相比，pyrH更适合于弧菌的种属鉴定，因此利用pyrH基因对马来西亚半岛鱼类样品中的弧菌进行了种属鉴定，证明pyrH基因能够可靠地鉴定石斑鱼样品中弧菌的多样性。