1.从地质结构上看，贝加尔湖是一个断谷洼地，一个深达地下15至20公里的大裂缝。贝加尔湖及其汇水区是世界上独特的地质系统。贝加尔湖位于东西伯利亚的中心地区，靠近亚洲的地理中心。贝加尔湖河谷洼地是西伯利亚重要的天然屏障。这种天然屏障分隔了不同的动物和植物，在这里生长着许多独特的生物群落。

2.贝加尔湖位于一个深深的构造山谷中，周围群山环绕，其中一些山峰比湖面高出2000米(6560英尺)。湖底的沉积物有6100米(20000英尺)厚。海岸上有死火山遗址。

3.湖底谷两岸地形不对称，西岸陡坡，东岸缓坡。8%的湖泊很浅，只有50米(160英尺)深。该湖蜿蜒的海岸线长达2100公里(1300英里)，在巴尔古金湾、奇维尔库伊斯基湾和普罗瓦尔湾，以及阿亚亚港和弗罗利哈港都有大面积的凹陷。东海岸有一个延伸入湖的半岛，名为SvyatoyNos半岛。湖中有27个岛屿，其中最大的是奥利洪达岛(长71.7公里，宽15公里，面积约730平方公里)。大柳什卡尼岛占地8平方公里(3平方英里)。

4.地壳运动仍在继续，偶尔有强烈地震；每年贝加尔湖都会发生约2000次地震，其中大部分都是小型地震，只能通过地震仪探测到。每十到十二年就会发生五到六级地震，每二十到三十年就会发生七到九级特大地震，有时震级可能更高。1962年和1959年，中央湖盆地发生了两次大地震。1959年，一场9.5级的地震使湖水下降了15到20米。1962年的10级地震导致色楞格河北部河口下沉，面积达200平方公里。最近形成的普罗瓦尔湾的深度是3米。地壳中、湖底的洞穴和裂缝中有新的热矿泉，地下热气不断从这些洞穴和裂缝中释放出来，使附近的水温升高到10。