原北京大学始建于1898年，孙家鼐(1898.07-1900.00)任首任校长。

清华大学的前身清华学堂始建于1911年，周子琦(1911.2-1912.4)任首任校长。

1. 北京大学，简称北京大学，创建于1898年。它最初被命名为北京大学。民国成立后，先后更名为北京大学、国立北京大学。

1916年至1927年，蔡元培担任北京大学校长期间，对北京大学进行了改革，将北京大学建设成为一所以文理为主的综合性大学，使北京大学成为新文化运动的中心和五四运动的发源地。1937年，抗日战争爆发后，北京大学与清华大学、南开大学合并，成立国立西南联合大学。

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清华大学，简称清华大学，前身为清华学堂、清华学堂、国立清华大学，是一所位于中华人民共和国北京市海淀区清华园的公立大学。始建于1911年，它的名字来源于北京西北郊的清华花园。1925年，为留美学生建立了一所预备学校，设有“旅游与美学系”和附属的“留美学生学校”。

抗日战争爆发后，清华大学、北京大学、南开大学南迁长沙，成立国立长沙临时大学，1938年迁至昆明，更名为国立西南联合大学。1946年迁回清华园，恢复营业。设有文学院、法学院、理学院、工学院、农学院等5个学院。1949年中华人民共和国成立后，国立清华大学划归中央人民政府教育部，更名为“清华大学”。

1952年，中国高校进行院系重组，清华大学文学院、法学院、理学院、农学院和航空航天学院从其他大学吸收工科，成为一所多学科的工业大学。在土木工程、水利、计算机、核能等领域做出了突出贡献，被誉为“工程师的摇篮”。1978年以后，科学、人文社会科学、经济和管理学科逐渐恢复。

1999年，原中央工艺美术学院并入美术学院。2006年与北京协和医学院合作培养临床医学专业学生。2012年，原中国人民银行研究生部并入五道口金融学院。