不同的耕作方式对水管理有不同的要求。常见的问题如下：

1.水质

成年甲鱼密度大、水深、水体小、自净能力差，集约化养殖对水质控制要求高。请参考“幼鳖养殖”一节进行控制。

甲鱼常温混养或单养一般池塘大水深，水生生态系统生物多样性程度高，水体自净能力强，水质容易控制。但同时也要考虑到混养包括很多鱼类，水质过肥和黎明时容易缺氧，所以要及时注入淡水，定时开启增氧机增氧。每隔10 ~ 15天加入生石灰(10 mg/L ~ 15 mg/L)，调节池水的PH值在7.5 ~ 8.5范围内。

混养池塘在必要时应照常施肥，但以发酵腐熟的有机肥为主，并坚持“少量多次”的原则，使池塘水肥稳定，水色以浅油绿色或深绿色为宜。

2.水位

成龟池的水位一般保持在1m左右，会根据天气情况有所增减。太深，龟在上下呼吸动作中消耗体力过多；太浅，水质多变。一般情况下，水位应避免大起大落，雨后水位不应急剧上升，久旱后水位不应急剧下降，水位应控制恒定。

3.水温

甲鱼的摄食完全由水温控制。尤其是在加热条件下饲养的龟，因为习惯了高温，对饲养水的温度要求似乎更高。与幼龟和幼龟相比，成龟的摄食水温范围更窄。因此，在日常管理中，水温的变化不容忽视，应尽量保持在301~ 2的水平。

在常温养殖中，还有水温调节的问题，尤其是每年的早春、深秋、盛夏。早春和深秋，气候不稳定时，水位要适当加深，防止水温变化频繁而迅速；盛夏水温达到34 ~ 35时，也不利于甲鱼的生长。水位要及时加深降温，使甲鱼始终生活在适宜的水温范围内。

充气

特别是在集约化的龟塘里，容易缺氧，产生有毒气体(沼气、硫化氢等。);及时曝气充氧可以加速这些气体的逸出，净化水质。一般溶解氧与透明度的关系如下：池塘水透明度在30cm范围内时，溶解氧约为4 mg/L ~ 5 mg/L，环境最适合甲鱼生长。

如果以水中氨的浓度为标准，20 mg/L ~ 30 mg/L时甲鱼生长正常，70mg/L时食欲下降，要及时换水，100 mg/L以上容易致病。

无论是控温养殖还是自然池塘养殖，都需要在甲鱼池塘中放养一些水生植物(如浮莲、浮萍)，既能为甲鱼遮荫，又能净化水质。