无论甲鱼市场如何变化，鱼苗、饲料、能源等因素紧张，导致生产成本增加，养殖户唯一能自己控制的就是养殖技术水平和成活率。随着甲鱼养殖业的逐年发展，养殖技术也在不断成熟和更新。很多地区养殖水平日臻完善，成活率普遍在90%以上。但很多养殖户仍然忽视鱼苗的选择，导致甲鱼患病死亡，甚至影响到养殖后期商品甲鱼的成活率。如何让养殖的甲鱼长得又快又好，很重要。

目前由于种质衰退严重且速度快，很多优良品系逐渐失去了原有的优势，抗病性和成活率大不如前。目前市场上现有的品系主要有台湾省甲鱼、泰国甲鱼、中国甲鱼(湖南、海南、江西、浙江松阳和太湖甲鱼品系)、黄河甲鱼、日本甲鱼、美国珍珠甲鱼、美国角甲鱼和部分地方杂交甲鱼品系(日本甲鱼和中国甲鱼、黄河甲鱼和日本甲鱼等)。).此外，还有少数国家二级保护动物——海龟。

目前台湾省甲鱼和泰国甲鱼市场份额最大，鱼苗成本相对较低。这两个品系的甲鱼在温室养殖中具有一定的生长优势。如果管理得当，经过八九个月的配种，平均体重可达0.7-0.9公斤。台湾省甲鱼与两品系甲鱼相比，抗病能力相对较弱，易受病原体死亡，但外观相对较好，个体较大，孵化率较高；而泰国甲鱼抗病能力强，成活率高，但孵化率低，同等重量下外形略小。中华鳖、日本中华鳖、黄河中华鳖具有生长优势。这三个品系在温室中生长速度不如台湾省中华鳖和泰国中华鳖，但在外池中生长迅速，抗病能力和越冬性能远远优于前两个品系。从生长速度和产量来看，日本甲鱼和黄河甲鱼略好于中国甲鱼。从外形上看，日本甲鱼是圆形的，中国甲鱼是椭圆形的，黄色甲鱼是淡黄色的，很漂亮。但部分杂交龟品系是否具有亲本优势，还有待进一步验证。

截至目前，除了小鳄龟、大鳄龟等美国流行龟的引进，珍珠龟、角龟等龟类的引进也逐渐升温。美国珍珠甲鱼，又名佛罗里达甲鱼，全身黑色，背盘有白色点状花纹，体形圆润，年生长速度快，3-5公斤。甲鱼体色黄，裙边金黄，生长速度可观，每年可长2.5-4斤。目前这两种甲鱼的商品价格基本维持在50-60元/斤，鱼苗在60-80元/斤，视市场情况不同而定。

中华绒螯蟹作为我国中华鳖的另一个物种，虽然没有中华鳖漂亮，但在生长速度和抗病能力上却优于中华鳖。由于该物种属于国家二级保护动物，尚未形成一定的市场规模和趋势。目前每株苗大概150-190元。

鉴于目前各种品系、各种鱼苗的生物学特性和生长特性的差异，价格也有很大差异。鱼苗的差价从三四元到一五六十元不等，商品价格从每斤十元到六七十元不等。所以养殖户要根据自己的实际情况和承受能力，选择相应的鱼苗进行养殖。