宝应县下辖安义镇、凡水镇、下集镇、六宝镇、射阳湖镇、广阳湖镇、罗多镇、小官庄镇、王志岗镇、草甸镇、西安丰镇镇、山阳镇、黄城镇、精河镇等14个镇。

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调整后，下辖14个镇和2个乡。

2000年，宝应县辖13个镇，3个乡。

根据第五次人口普查数据：全县总人口869972人，各乡人口：安义镇171789西水镇77769西集镇58721六宝镇51202舍阳湖镇54942广阳湖镇31601鲁多镇34014小官庄镇29223王志岗镇56440曹店镇63782西安市丰镇33630山阳镇2001年，江苏省民政厅(苏民区[2001]61号)批准撤销精河镇，设立精河镇原辖区。实行镇管村制度。

杨府府[2002]6号文于2002年和宝应县人民政府[2002]6号文于2002年1月17日分别予以批复和批准。

2002年，宝应县国土面积1461平方公里，其中建成区面积13.09平方公里。下辖安益镇、凡水镇、山阳镇、草店镇、陆多镇、西安丰镇、望治港镇、小官庄镇、下集镇、射阳湖镇、光阳湖镇、六宝镇、黄城镇、静河镇、沿河镇水四乡15个镇、1个乡、53个居委会、235个村委会。

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合并后，射阳湖镇面积194平方公里，人口9.35万，辖33个行政村，3个居委会，镇政府设在桥南村。

2003年，宝应县总面积1461平方公里，其中建成区面积13.09平方公里。下辖安义镇、凡水镇、山阳镇、草店镇、陆多镇、西安丰镇、王志岗镇、小官庄镇、下集镇、射阳湖镇、光阳湖镇、六堡镇、黄城镇、静河镇、沿河镇15个镇、51个居委会、234个村委会。

辖社区居委会(闸北、罗巷、柳沟、东门、雪屯、市区、安义、花川、排楼、桃园、苏中、安民、太圣洞村、白田、大桥、铁桥、东胜、石基园、七新、三里、石寨、三团、白田)村委会(华庄、北港、西郊、西港、北寨、南扎、西柳铺、湖渔场)

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下集镇：辖居委会(镇、郭氏桥、虹桥)村委会(双居、苏崖、下集、双塘、姜庄、赵勇、通口、塘北、游营、香庄、三阳河、望营、卫星、望桥、望桥、收获、人民)。

六堡镇：辖居委会(崖坡、烟阳田、路村);村委会(映湖、郑都、六堡、团庄、永银、亭白、寿林、王同河、建设、仁里、张源、新安、联丰、清远、鲁东、乌阳、塘新)。

射阳湖镇：辖射阳湖渔村居委会(藏辰、天坪、水寺)村委会(桥南、油坊、王鲲、高霞、四连、廖旭、戴庄、平江、凤车头、吉峰、马墩、四河、槐树、大桥、杨柳、赵琴、平南、山南、集新、集新、江宝、临上、洛潮、戴宝、吊一、崇林、渭当、新农、襄阳)。

光阳湖镇：辖居委会(荥阳)村委会(河湾、各庄、燕桥、桥头、白鼠、快、西溪、三联、东溪、小家、兰亭、东津)。

罗多镇：辖居委会(罗多集镇)村委会(陶林、贾林、朱斗、罗多、三新、剑青、武青、党口、鲁庄、崔旺、陈兴、何佳)。

小官庄镇：辖居委会(小官庄集镇)、村委会(小官庄、城中、祖泉、南昌、方沟、石县、王伟、双闸、杨江)。

望治港镇：下辖屋委会(兴港、强石当当)村委会(北河、国强、星火、张楼、兴盛、大树、和平、军师、爱沱、马垛、武宝、西荡、月托营、望治、中墩、石庄、牌坊、南沙、北沙)。

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西安市丰镇：辖居委会(西安市丰镇、吉峰、天亭)、村委会(朱果、崔度、南社、华亭、临溪、张吉、苗圃、太仓)。

山阳镇：辖居委会(山阳、万源)村委会(兴通、拱辰、盐湖、金庄、春光、阳河、徐庄、河新、乌坝、大东、徐阳、终南、顺河、广汇、松阳、西铁城)。

黄城镇：辖居委会(黄城镇)村委会(徐店、小栈、西峰、联合、江跳、大陆、大李庄、鱼桥)。

镜河镇：下辖居委会(镜河、张桥、黄埔集镇)和村委会(镜河、景农、钱庄、大同、黄埔、刘家滩、草坝、柳上、陈东、太徐、东红、虹桥、松竹、枣湖、左铺、蔡桥、陈桥、张北)。

沿河镇：辖居委会(南窑)村委会(郑和、刘普、贾桥、陈佳、潘桥、刘庄、广沟、郭庄)。

开发区管委会：村委会(七里、锦湾)。

2004年底，宝应县辖15个镇。

安义镇占地面积93.91平方公里，人口9.3万人。

泛水镇面积167.55平方公里，人口84058人。

下集镇面积122.00平方公里，人口61074人。

六堡镇面积167.34平方公里，人口54028人。

射阳湖镇占地面积181.50平方公里，人口92899人。

光阳湖镇占地面积90.20平方公里，人口37935人。

勒多镇占地面积61.30平方公里，人口34809人。

小官庄镇占地面积46.00平方公里，人口30774人。

王志岗镇面积90.00平方公里，人口59,843人。

草甸镇占地面积1万平方公里，人口70984人。

西安丰镇市面积58.54平方公里，人口36742人。

山阳镇面积123.43平方公里，人口57786人。

黄城镇面积4200平方公里，人口28323人。

景河镇面积83.17平方公里，人口60790人。

沿河镇面积47.44平方公里，人口39302人。

2005年10月，经江苏省人民政府批准(苏政复[2005]89号文)，将宝应县沿河镇与安义镇合并，成立新的安义镇，镇政府设在安义镇。

行政区划调整后，安义镇新行政区域面积153平方公里，人口19.95万人。下辖21个居民委员会和21个村民委员会。

截至2005年12月31日，宝应县下辖14个镇。