1.水质恶化引起的鳃疾病

水质恶化引起的鳃部疾病集中在7月至9月。这种情况下，水污染严重，水中氨含量长期超标。受分子氨刺激，鳃分泌大量粘液，鳃呈紫红色，边缘呈白色。鳃片表面覆盖的大量粘液严重影响气体交换。在炎热的夏天，当水温在中午时，鱼经常浮在水面上。病鱼吃得少，长得慢。受试鱼的鳃没有细菌性烂鳃病的症状；镜检一般无寄生虫或寄生虫很少。如果结合水质监测，确实是水中氨氮含量超标，可以诊断为水质恶化引起的鳃部疾病。

2.细菌引起的鳃疾病

细菌性烂鳃病通常发生在4-9月份，病原菌为柱状挠曲杆菌。病鱼腮上粘液增多，腮肿，腮带血，紫红色甚至有小出血点。严重者，鳃坏死脱落，鳃末端缺损，软骨外露；坏死细胞、粘液、圆柱弯曲杆菌和各种污染物经常粘附在患病的鳃丝上。当这些附着物主要是粘液和柱状弯曲菌时，呈淡黄色；其边缘颜色变浅，呈“磨边”状。由于鳃丝被细菌感染，鳃盖内表面的皮肤常发生红肿、充血，中部常被侵蚀成圆形或不规则的透明窗。显微镜检查表明，如果鳃上没有寄生虫或真菌，可以初步诊断细菌性烂鳃病。进一步检查，取干净的载玻片，加入2-3滴无菌水(或清水)，刮掉鳃上的淡黄色粘液，或在病变处切少量鳃丝放入载玻片上的水滴中，盖上载玻片静置20-30分钟。在显微镜下，可以看到大量细长的可以滑动的细菌，有的细菌聚集成柱状。可以进一步确认为细菌性烂鳃病。

3.原虫引起的鳃疾病

原生动物引起的鳃部疾病集中在7月至9月。引起鱼类鳃部疾病的寄生虫主要有柳杉、旋毛虫和轮虫。病鱼的鳃组织受到寄生虫的刺激和破坏，导致鳃表皮损伤充血，表面布满粘液，鳃丝尖端常因细菌感染而腐烂。患病鱼呈黑色，游动缓慢，大量鱼苗、鱼种可致命。显微镜下，低倍镜下可以看到寄生虫。

4.中国鲭鱼引起的鳃部疾病。

由中国鲭鱼引起的鳃部疾病在6月至9月流行。由于体型较大，肉眼可见寄生在鳃末端的白色蠕虫。由于鲅鱼的第二肢钩在鳃丝末端，使鳃丝末端增生、膨胀、变白，鲅鱼的虫体后半部分露在鳃丝外，像一条小白蛆。特别是在鲭鱼的繁殖季节(水温在20以上)，生殖节上挂着一对细长的卵囊，用肉眼可以看得更清楚。当出现大量寄生虫时，几乎所有鳃丝末端都出现肿胀和白色，肿胀和白色的基部充血，鳃上粘液增多，病鱼呼吸困难，坐立不安，在水面上游来游去或狂乱游动，尾鳍上叶常露出水面。一般少量的中国鲱鱼寄生时，对鱼的伤害很小，只有大量的中国鲱鱼寄生时，才会造成病鱼死亡。因此，在作出诊断时，需要用肉眼检查病鱼的其他部位，看是否有病变或异常，必要时用显微镜进一步检查，以防误诊。