鸵鸟蛋的孵化率是一个综合目标，受多种因素影响，但最重要的是鸵鸟蛋的质量和孵化期的管理。抓住以下几点，孵化率会大大提高。(1)鸡蛋产生后及时捡拾。太阳不宜长时间暴晒，因为低温会使胚胎内温度升高，杀死胚胎。夏天不能让鸡蛋冻着，也不能用手拿。你应该用消过毒的毛巾把它们包起来，然后马上送到保育箱。(2)消毒种蛋常用的消毒方法有两种：一种是洗蛋。洗蛋前必须将种蛋表面的泥土或污垢悄悄刷掉，然后用1: 600的混合液冲洗或喷洒。洗完之后自然是晾着无聊。切记不要用湿布擦拭。二是熏蒸，熏蒸一定要控制剂量和时间。一般每立方米用40%福尔马林15毫升，高锰酸钾7.5克，熏蒸时间一般不超过17分钟。(3)消毒后立即将储存的鸡蛋放入鸡蛋储存室，鸡蛋的储存时间通常不超过7天。储存鸡蛋时，鸡蛋的气室应该朝上。鸡蛋储存室的温度应控制在13 ~ 16之间，最好不超过17，湿度应控制在45%左右，不超过60%。鸡蛋存放间的空气要流通，存放过程中不要随意翻动鸡蛋。(4)温度孵化温度是孵化成功的决定性因素。比如低温低湿孵化会使卵子内膜穿孔，紧紧包裹胚胎，肠道胎儿发育较弱，成活率低；但高温孵化会延长孵化时间，形成孵化前蛋黄不吸收、浮肿的鸟，孵化率也低，所以孵化温度不宜低于36。详细情况要根据不同季节、不同孵化期、南北地区的温差来掌握。(5)湿度也是影响孵化率的重要因素。孵化湿交过大，容易形成浮肿鸟；如果孵化湿过小，胚胎会失去太多重量，形成强壮的胚胎而死亡。孵化的湿度一般由种蛋失水率决定。种蛋孵化的最适湿度一般为22%。如果湿度过高，应对室内空气进行除湿。(6)呼吸翻蛋呼吸翻蛋也是影响种蛋孵化率的因素之一。胚胎发育需要呼吸，从空气中吸入氧气，呼出二氧化碳。缺氧会导致胚胎死亡，雏鸡虚弱。目前出口和国内的孵化器都可以保证空气交换，避免缺氧，但是需要保证进入孵化器的空气是新鲜的。此外，为了保证蛋的平均受热，避免壳膜粘连，可以将保温箱设置为两小时(90度)或一小时翻一次。(七)孵化设备自从鸵鸟引入中国后，一直在持续使用出口的孵化设备。从孵化效果来看，国产机可以媲美出口机。但是因为国内的孵化设备没有除湿部件，所以需要停止对孵化室的空气进行除湿。除以上几点外，孵化器内的人员必须严格遵守环境卫生和消毒制度。任务人员进入孵化室必须淋浴、更衣、换鞋、踩消毒水，非任务人员不得进入孵化室。只有这样，才能更好更有效地提高鸡蛋的孵化率。