在养猪业中，杂交育种是各种生产系统中应用最广泛的方法，因此遗传改良的目标是提高杂种在商业环境中的生产性能。杂交育种有两个明显的优点：(1)杂种优势和(2)品种互补。所谓杂种优势或杂种优势，是指杂交后代的表现优于亲本。如果你想了解更多关于杂种优势的知识，可以访问以下网站(http://www . genes us.com/global-tech-report/杂种优势)。品种互补是指将纯品种中的特定育种性状组合到同一个后代中，但在一个品种中同时改良两种性状是非常困难的。在传统的杂交育种体系中，商品杂交猪通常以金字塔育种模式进行。在塔顶，通常进行基因选择，即在核心群体中选择目标基因，在塔基中的位置，也就是我们遗传改良的目标，提高商品猪的生产性能。由于经营形式、健康状况、营养状况和环境因素的不同，核心群和商品猪群之间的猪生产性能也存在差异。核心群和商品猪群之间同一性状的遗传参数可能小于1，这也说明两个群体之间可能存在可控性状的差异。如果性状的遗传参数约为0.7或更低，那么我们建议将从商品猪获得的数据用于遗传评估项目，以便从杂交群体中获得更多的遗传反应。魏和(1991)提出了一种称为杂种与纯种联合育种的方法。简单来说，就是利用杂交近亲的表型/系谱信息，在核心群内繁育纯种动物。与纯种繁育不同，联合繁育的优点是可以获得长期的遗传反应，但也会带来麻烦，即近交率会增加，需要持续监测生产性能，并在商品种群中记录系谱(Bijima et al .2001)。联合育种的方法要求在商品群和核心群中都要使用纯种公猪，这样从核心群中选出的后代才能从商品猪水平获得半同胞优势。CCPS方法的主要限制因素是对公猪的要求和系谱的准确记录。随着分子遗传技术的最新进展，高通量测定单核苷酸多态性(SNP)的成本更低，因此我们可以利用该技术解决许多问题。基于SNP的信息，我们可以提出多种基因选择方法来培育杂种性状的纯种亲本。德克斯(2007)描述了一种称为CC-MAS的方法，即将商业杂交水平估计的标记效应应用于核心群亲本的选择。为了实施CC-MAS方法，需要估计从纯种中分离的SNP标记对杂交性状的影响，这就要求我们从杂交水平收集基因型和表型信息，并对纯种的亲本进行监测。图1显示了这种方法的示意图。许多研究结果表明，这种方法不仅可以提高杂交性能的反应，还可以降低近交率，并且不需要记录杂交级别的复杂谱系信息。最近，许多学者(曾等，(2013)和Esfandyari等，(2015))提出了一种新的评估混合性能的方法，即在模型中加入主导因素，可以更准确、更廉价地完成评估。因为这些方法都是基于模拟数据，所以在实施这些方法之前还需要进一步的验证。综上所述，需要收集更多的商品猪水平的信息(基因型或表型，或者两者都有)，才能将杂交的信息融入到纯品种的评定中，所以在育种计划上还是需要投入更多的资金。嘉鱼公司一直在投入巨资收集商品猪的基因型和表型信息，并将收集到的信息整合到日常的遗传评估过程中。通过这一过程，我们将为嘉鱼的客户提高基因改良率和产量。