另一种提高产仔数的基因组工具
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产仔数是决定母猪盈利能力的重要因素。增加同窝产仔数的主要限制之一是怀孕第二至第三周的胚胎损失(Geisert和Schmidt,2002,Jani MSCI。80,E54-E65)。
许多因素都可能导致胚胎丢失,胚胎早期死亡的一个可能原因是必需基因中可能存在一些有害的等位基因(一个基因的不同形式),这将导致母猪怀孕后不久胎儿死亡。这些有害等位基因的频率可能会在长期选择更多的产仔数后下降,例如在母系品种中。但有些品种不选择增加产仔数(如杜洛克),这些有害等位基因可能被忽略(或隐藏),频率高于选择群体。
通常这些有害等位基因在纯合状态下(称为隐性,从父母双方各获得一份有害基因,如aa)会导致胎儿死亡。当它们处于杂合状态时(遗传自母亲和父亲的等位基因不同,如Aa),个体存活,行为正常。这种被称为载体的杂交动物很难识别,因此它可以继续在种群中传播有害的等位基因。
基因组技术现在提供了一种最先进的方法来检测这些有害的等位基因,这些等位基因在未经选择的群体中相对常见,但在活体动物中不会出现隐性纯合。通过统计分析,该方法只需要具有正常表型(即活体)的个体的基因型数据就可以检测有害等位基因。该方法最初用于奶牛检测与出生缺陷相关的等位基因(VanRaden等人,2011,JdairySci.94,6153-6161)。最近在猪中进行了更多的研究,在母系和/或商业系中发现了一些与较小的产仔数和更多的死胎相关的等位基因(Haggman和Uimari,2017,Janimbridge Net。134, 129-135;霍华德等人2017,GSE.49,57;Derks等人,2017,BMCGenomics.18,858)。
在嘉鱼基因组数据库中,我们拥有数千头猪的丰富基因型数据(60K、80K、650K和序列宽度),这使我们能够搜索这些与产仔数相关的潜在有害等位基因,并通过大量的表型收集进一步估计它们对公猪繁殖的影响。我们最初的工作集中在650KSNP基因型在杜洛克公猪中的应用。已经发现基因组的几个区域含有潜在的有害等位基因。例如,对于最显著的SNP,我们预测应该有45个纯合隐性(aa)个体,但我们没有观察到。含有SNP的区域与更多的木乃伊胎显著相关(P0.001)。
与之前关于猪的报告(见上文)相比,所鉴定的基因组区域似乎在某种程度上是特定于品种或群体的,尽管我们确实看到一些区域可能与之前的发现重叠。
这些发现为提高嘉鱼杜洛克猪的产仔数提供了有价值的信息。它不仅会产生更多的猪,还会通过更高的选择强度来改善遗传进展。降低这些有害等位基因频率的方法包括使用嘉鱼定制SNP芯片的基因组选择和基于基因组的匹配计划。
这些研究成果的实施将为佳誉的目标做出巨大贡献,即增加佳誉客户的价值和盈利能力。
嘉鱼欢迎张春燕博士。
嘉鱼非常高兴地宣布张春燕博士被任命为遗传学家。
自2010年获得博士学位以来,春燕一直在法尔贝塔大学担任家畜遗传学GrahamPlastow博士项目的博士后研究员,最近担任研究助理。
她积极参与了几个研究项目,重点是利用基因和基因组方法改善猪肉生产中的重要经济性状。她与种猪公司合作,开展行业驱动的R&D项目。
在她的新角色中,春燕将通过整合基因组技术开发和实施国内外资助的研究项目,重点是改善猪的遗传改良。作为嘉鱼育种项目团队的一员,她将与其他团队成员和大学人员合作开展R&D项目和技术服务。此外,她将为嘉鱼在中国和亚洲的核心团队提供直接监督和支持,并为嘉鱼在中国和亚洲的销售团队提供技术支持。
“我们期待春燕为我们的项目做出贡献。我们在家畜遗传学的几个成功项目上与她合作。她的技能、经验和参与猪肉行业的愿望使她成为这个职位的最佳人选。我们的基因改良和R&D项目不断扩大,找到合适的人来支持和推动这些项目的发展是基因工程和研发未来的关键,”基因项目研发副总裁BobKemp说。
春燕毕业于华中农业大学,获得学士和博士学位。2014年至2016年,她获得了阿尔伯塔大学Mitacs高级博士后奖学金。她在同行评审的科学期刊上发表了20多篇文章。
春燕与丈夫和两个孩子住在艾伯塔省的埃德蒙顿。
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