在集约化饲养过程中，新技术、新产品的应用和免疫水平的不断提高，为有效控制和根除家禽疾病提供了有利条件。但是，由于传统散养养殖方式的盛行，集约化的家禽养殖场仍然被小群体的散养所包围，自然界的病原微生物对家禽养殖场的威胁依然存在。一些家禽养殖场存在饲料营养成分不全、消毒药物种类少、质量差、疫苗种类不全、质量差、缺乏与时俱进的诊断技术、畜牧兽医人员不足、防疫消毒设备不全、不同品种、不同年龄、不同用途的家禽混养等诸多不足。导致防疫措施难以奏效。现代集约化养鸡场疫病的发生和流行呈现出新的特点。

新的流行病正在增加，传染病正在造成严重的危害。

据普查，到目前为止，威胁我国养禽业的传染病有70 ~ 80种(仅80年代就有30多种)，其中禽类传染病造成的损失，占禽类疾病的75%以上。随着国外家禽新品种的频繁引入，新的家禽疾病也随之传入。此外，随着家禽养殖场使用年限的增加，疾病种类也在增加。

疾病多样复杂，各种原因导致的混合感染增多。

传染性法氏囊病(IBD)过去只感染鸡，但现在它也能引起鹅、鸭和野鸡的疾病。大肠杆菌病有新的脑型、肿头型和眼型。过去对鸭鹅不致病的禽流感和禽副粘病毒病，现在可以造成这些水禽的大量死亡。集约化养殖的特点决定了家禽疾病往往呈现多发性、复杂性感染，很少单独发生。

家禽疾病的典型变化是非典型的。

实践中经常发现，许多禽病不再表现出教科书上所描述的典型症状和病理变化，而是表现出一种新的面貌，即不典型。例如，过去以发病率高、死亡率高、临床症状典型为特征的新城疫，正逐渐被发病率低、临床症状不明显、病理变化不典型、死亡率低的非典型新城疫所取代，使得该病的诊断和预防更加困难。

加重了多种禽病混合感染的危害。

临床诊断中混合感染病例较多，包括病毒性禽病混合感染，如禽流感与新城疫或大肠杆菌病、鸡法氏囊病与新城疫、新城疫与传染性支气管炎、雏鸭细小病毒病与小鹅瘟等。病毒性和细菌性家禽疾病的混合感染，如新城疫和大肠杆菌病、新城疫和沙门氏菌病；家禽疾病的混合感染，如鸡大肠杆菌病和沙门氏菌病。这些病原菌的混合感染增加了疫情诊断和预防的难度。

有条件的病原体变成无条件的病原体。

在目前的家禽养殖过程中，许多病毒性疾病已经得到控制，但细菌性疾病越来越严重，如大肠杆菌病、鸡白痢、沙门氏菌病、慢性呼吸道疾病和传染性鼻炎。此外，还有机会致病菌引起的疾病，如铜绿假单胞菌、肉鸡矮缩病综合征等，以前从未引起重视。因为饲养环境不舒服，经常爆发。