目前，东北大学设有文学系、教育系、法律系、经济系、理系、工程系、医学系、医学系、牙科学系等10个系，开设专业课程379门。 研究生院设有文学、教育学、法学、经济学、理学、工程学、医学、药学、牙科、农学等10个研究部门。学校设有金属材料研究所、选矿与冶炼研究所、抗真菌研究所、科学计算研究所、高速力学研究所、电子通信研究所、非水溶液化学研究所等7个研究所，遗传学研究中心、大型计算中心等2个国家级设施。 全校使用的机构有：低温中心、应用信息科学研究中心、信息处理教育中心、遗传实验室、环境保护中心、计算中心、百万伏电镜室、卫生保健管理中心。 专业设置 文学研究系 文化科学、语言科学、历史科学、人文科学 教育学研究部 综合教育科学评价与教育设计 法律研究部 综合法制(法律与科技学院)、公共法律与政策(公共政策学院)、法律与政治理论研究 经济学研究部 经济、工商管理、会计 科学研究部 数学、物理、天文学、地球物理学、化学、地球科学 医学科学，残疾科学，健康科学 牙科研究学系 牙科学 药物研究部 侵入医学化学，医学医学，生命医学 工程研究学系 机械系统设计工程、纳米力学、航空航天工程、量子能源工程、电学 气体通信工程、电子工程、应用物理、应用化学、化学工程、生物工程、金属先进工程、智能装备材料科学、材料系统工程、土木工程、城市建筑、技术与社会系统、生物机器人工程 农学研究部 国际文化研究系 国际区域文化理论、国际文化交流理论、国际文化语言理论 信息科学研究部 基础情报学、系统情报学、人类社会情报学、应用情报学 分子生命科学、生命功能科学、生态系统生命科学 环境科学系 医学工程研究部 医学工程 教育资讯研究学系 教育信息 专业职业学院 法律与技术学院，公共政策研究生院，会计学