性质不同：自主支付是指一方决定自己用自己的资金支付，而委托支付是指受另一方的委托，可以代表资金支付，也可以在收到后按照被委托人的要求支付。

程序不同：自主支付按本单位正常程序完成，委托支付按正常程序完成。

后续处理是不同的，前者正常记录，后者则要完成复式分录，返回委托方

自主支付与委托支付的区别委托支付与自主支付的区别：(1)委托支付是指用户在使用资金前需要向银行或第三方金融机构申报和申请。申请批准的，可以使用；未获批准的，不能使用。(2)自主支付是指用户在使用贷款资金前不需要向银行或第三方金融机构申报和申请，用户可以自主使用和分配资金。但是，资金的使用方向必须与合同约定一致；否则，银行和第三方金融机构有权扣留贷款，提前接受贷款。

2. 委托支付是贷款资金的一种支付方式，是指贷款人(依法设立的银行业金融机构)根据借款人的提现申请和支付授权，将贷款资金支付给符合合同约定目的的借款人的交易对象，以降低贷款被挪用的风险。贷款资金单笔金额超过项目总投资的5%或超过人民币500万元的，适用委托支付。有利于提高商业银行贷款发放质量，加强对贷款全过程的科学管理。也有利于管理，能够真正实现贷款管理。商业银行可以加强贷款风险管理模式，由粗放型向精细化型转变。自主支付是指贷款资金可以由借款人自行使用，无需银行批准，但如果借款人违反贷款合同使用贷款资金，银行有权随时提前催收。

独立支付与委托支付的区别在于，独立支付是指银行在发放贷款时，按照金融监管部门的要求，将一定贷款额度下的贷款直接发放到贷款客户的账户上，贷款资金由贷款客户自由拨付。

委托支付是指一定金额以上的贷款，需要借款人在贷款前提供委托支付合同，贷款银行将贷款资金汇入委托支付合同的交易对手的账户。