继东京大学和京都大学成立后，九州大学于1911年成立，只有两个学科：医科大学和工程大学。1919年，根据《大学条例》的修订，将原来的两个分校改为医学院和工程系，并成立了农业部。在接下来的六年里，法语系和科学系又增加了。第二次世界大战后，日本的教育体制彻底改革，九州帝国大学更名为九州大学。不久之后，法语学部被分成三个部分，包括法律学部、文学学部和经济学部，并增加了教育学部。与此同时，福冈高中和久留姆工业大学合并为九州大学。在那之后，又增加了教育、医学和牙科部门。1953年九州大学研究生院成立。2000年，为了更好地开展跨学科、跨部门的教育和研究，成立了“高等院校研究院院”。随着2004年国立大学的合并，九州大学也成为国立大学法人九州大学，进一步加强了大学的独立性和自治性。占地275公顷的伊都校区的一部分已于2005年投入使用。根据2005年的统计，该大学由11个学部、17个大学、16个研究所、3个附属研究所和医院组成，约有18 200名学生，约有2 320名教师和2 150名工作人员。截至2006年5月1日，九州大学共有1141名外国留学生。

1903年4月，京都帝国大学的分校——京都帝国大学福冈医科大学成立，这就是九州大学的前身。当时，由于国家处于一片废墟的状态，在财政、土地购买和学校建设方面都无法满足要求。因此，8年后的1911年，九州帝国医科大学正式成立。与此同时，九州帝国工程大学也成立了，这是九州大学成为今天综合性大学的基础。1947年更名为九州大学。1949年，包括位于福冈地区的旧九州大学在内的九州大学，加上九州大学附属医学部，福冈高中，久留姆工业学校，成为新的九州大学。旧福冈高中的设施和人员被并入九州大学第一分校(1955年并入九州大学第二分校，1963年改称教育系)，旧久留美工业学校成立为九州大学第二分校(1955年并入九州大学第一分校)。原四十八连陆军步兵营旧址被指定为第三分校(1951年废除)。2003年，九州艺术与工程大学根据第29号法律成立。2004年，九州艺术与工程大学由政府直接建立和管理的国立大学转变为国立大学法人。

九州大学的校园比较集中。除了位于九州内外的农场、林场、海洋火山观测站等附属研究设施和实践基地外，教学、科研和行政基础设施均位于福冈。为了赶上新技术革命的快速发展，日本政府最近将能源、空间科学和癌症这三个重点前沿研究项目分配给了几所基础雄厚的国立大学。九州大学就是其中之一。例如，日本政府每年投资100亿日元用于设备改造和研究，通过室内核聚变开发新能源。

九州大学超导与等离子体系积极参与了该重大项目的研究。此外，九州大学在日本西部九州地区拥有完善的海洋、火山和地震预报网络。在癌症的研究方面，卫生署与其他大学合作，在癌症的病因、诊断和治疗方面取得了可喜的进展。九州大学一向有良好的学风，治学严谨，重视学生的实践与实践，教师重视启发式教学，毕业生都很受用人单位的欢迎。毫不夸张地说，今天的九州大学已经真正成为日本西部一所重要的高等学府。