南京工程学院之所以不被称为大学，是因为南京工程学院在大学规模、学科专业、师资队伍、教学科研水平等方面都不符合国家规定。

根据相关法律法规，“学院”更名为“大学”应满足以下两个基本条件：

一是要符合国家和地区高等学校布局结构的总体规划。

二是符合《高等教育法》、《普通高等学校设置暂行条例》、《普通本科学校设置暂行规定》(文[2006]18号)规定的“大学”名称使用条件和标准。

具体来说，要在办学规模、学科门类、教学科研实力强、教学科研水平高等方面，符合国家规定的“大学”的标准和条件；

(一)办学规模：全日制学生8000人以上，研究生人数不低于全日制学生总数的5%。

(二)学科及专业：

1. 在人文学科(哲学、文学、历史)、社会科学(经济学、法学、教育学)、理、工、农学、医学、管理学等学科中，至少应有三大学科。

2. 各专业学科本科通识专业应覆盖本学科3个以上一级学科，各专业学科全日制本科生人数不少于全校全日制本科生总人数的1%，并至少有2个硕士学位授予点，全校本科通识专业总人数不少于20人。

(3)师资队伍：具有硕士学位的专任教师比例一般达到50%以上，其中具有博士学位的专任教师比例一般达到20%以上；具有高级专业技术职务的专任教师一般不少于400人，其中具有正教授职称的专任教师一般不少于100人。

(四)教学科研水平：

1. 教育部组织的本科教学水平评价应在“好”以上。在近两届教学成果评价中获得国家级一、二等奖或省级一等奖2项及以上；

2. 科研水平高：

(1)人文社科类高校近5年年均科研经费不低于500万元，其他类高校近5年年均科研经费不低于3000万元。

(2)近5年科研成果获省部级奖励20项，其中获国家级奖励2项以上。

(3)省部级以上(含省部级)重点实验室2个，重点学科2个以上。

(4)一般具有10个以上硕士学位，并具有5年以上硕士学位的毕业生。

此外，它还需要满足国家在基础设施、实习和培训场地、学校资金和领导方面的要求。南京工程学院在学校规模、学科专业、师资队伍、教学科研水平等方面不符合国家规定。