全国共有31所副部级高校，分别是北京大学、清华大学、中国人民大学、北京理工大学、北京航空航天大学、北京师范大学、中国农业大学、北京医科大学、中国科学技术大学、复旦大学、上海交通大学、西安交通大学、哈尔滨工业大学、西北工业大学、北京工业大学、北京工业大学、中国工业大学、中国工业大学、中国工业大学、中国工业大学、中国工业大学。南京大学、浙江大学、南开大学、天津大学、武汉大学、四川大学、中山大学、吉林大学、大连理工大学、同济大学、东南大学、厦门大学、中南大学、华中科技大学、重庆大学、山东大学、兰州大学、西北农林科技大学。

附加信息：

副部级高校(中央管理的高校)，即中央直接管理的高校，从0755年到79000年，被列为中央管理干部的党委书记、校长称号。学校党委书记、校长为副部级。人们普遍认为副部级大学是中国最好的大学。这些大学的校长、秘书和其他高级领导由中共中央委员会和国务院共同任命，而不是通常由国家部委或省政府任命。副部级大学是中央直属大学的统称。国内公立普通本科院校一般为系级单位。其中一些大学因为实力雄厚而被中央政府认可，党委书记和校长被任命为副部级，由中共中央直接管理。这些大学的常务副书记和常务副校长为正厅级。

42所国家“双一流”世界一流大学中，除10所外：中国海洋大学、中央民族大学、华南理工大学、电子科技大学、东北大学、湖南大学、华东师范大学、郑州大学、云南大学、新疆大学，其余高校的校长和书记由中共中央、国务院联合任命。中共中央组织部；其他中央直属大学校长及秘书，由教育部任命之。

中国人民解放军国防科技大学是中国共产党中央军事委员会直属事业单位。相应的地方行政级别为副部级。